Profesor Franken Stein

El Dr. Franken Stein es el más poderoso tecnico que se ha graduado del Shibusen. El considera a todos y cada uno de los seres vivos, incluido él mismo, como sujetos de experimento. Es un gran luchador, puede luchar contra Black Star sin siquiera levantarse de su silla.
Stein se basa en los personajes centrales de la novela de Mary Shelley, Frankenstein, una fusión del científico loco y el monstruo en sí. Stein no está cuerdo del todo y constantemente tiene que reprimir el impulso de diseccionar todo lo que ve. Fue el compañero de Spirit durante cinco años, durante los cuales experimentaba con su cuerpo mientras dormía. Según Maka desde que Stein es su profesor no hacían mas que diseccionar animales, incluso una vez trató de diseccionar un ave en peligro de extinción alegando que sería malo que se extinguiera antes de que él pudiera diseccionarle. De hecho, incluso ha experimentado consigo mismo, ya que tiene un enorme tornillo insertado en el cráneo y suturas en todo el cuerpo y ropa, siendo estos sus rasgos mas distintivos. El Dr. Stein ocupa el puesto de Sid como profesor en Shibusen tras su muerte.
Stein puede controlar las vibraciones de su alma lo que le da una gran ventaja en batalla, ya que puede cambiar su propia longitud de onda para que coincida con la de su oponente y pasar a tener una relación usuario-arma. Stein puede utilizar esta capacidad gracias a su alta flexibilidad espiritual mediante la previa observación de su oponente. Él es un genio en la utilización de las vibraciones del alma, incluso desarmado puede canalizarlas a través de su cuerpo y las libera en forma de una poderosa corriente.
Stein tiene un famoso gag en el que intenta hacer aparición deslizándose sobre una silla de despacho con ruedas, pero siempre tropieza con un reborde del suelo y cae de espaldas; a pesar de esto, constantemente sigue intentado hacerlo bien.